کتابخانه های نوشته شده با جاوا اسکریپت

خط لوله تجزیه و تحلیل توالی RNA با استفاده از STAR، RSEM، HISAT2 یا Salmon با شمارش ژن/ایزوفرم و کنترل کیفی گسترده.

مجموعه ای از الگوهای اجرای Nextflow (توسط nextflow-io).

خط لوله تجزیه و تحلیل برای تشخیص انواع مولفه یا جسمی (پیش پردازش، فراخوانی و حاشیه نویسی) از WGS / توالی هدفمند.

خط لوله پیک فراخوانی، QC و تجزیه و تحلیل تفاضلی ChiP-seq..

خط لوله پیک فراخوانی و تحلیل QC ATAC-seq.

مونتاژ و باینینگ متاژنوم ها.

یک خط لوله تجزیه و تحلیل DNA باستانی کاملاً تکرارپذیر و پیشرفته.

فایل های پیکربندی برای تعریف پارامترهای خاص برای محیط های محاسباتی در مؤسسات مختلف (توسط nf-core) استفاده می شود.

اثبات مفهوم خط لوله RNAseq.

(WIP) بهترین جریان کار را برای بیماری های نادر انجام می دهد.

تایپ دقیق HLA از داده های توالی یابی نسل بعدی.

اثبات مفهوم خط لوله RNA-Seq با Nextflow.

نوع Germline Calling Nextflow Pipeline بر اساس بهترین روش‌های GATK4.